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PCR檢查支原體是對藥典方法的重要補充

更新時間:2020-11-13  |  點擊率:895

 

支原體是導致體外細胞污染的重要污染源。用于生物制品生產的細胞基質或治療性細胞。產品被支原體污染后,支原體或支原體代謝產物可進入人體,并對人體產生嚴重危害。因此,對支原體污染的有效檢測是確保細胞基質及治療性細胞產品質量的前提。


支原體傳統檢測方法為培養法和指示細胞染色法,這兩種均是“藥典方法”。但缺點是耗時長,靈敏度低。此外,這兩種方法均無法明確所感染支原體的類型。

因此,采用PCR或qPCR檢測支原體的高度保守序列,用于制藥工業的放行檢測,逐漸成為一種趨勢。當然,核酸擴增法也存在一定的問題,因為它檢的不是活的支原體,而是支原體的DNA。另外,它容易受到樣本基質中的物質干擾,如果靈敏度達不到,有時容易漏檢。而培養法的問題是,有些支原體無法在培養基上生長,因此也不會被發現。而核酸擴增法可以覆蓋100多種支原體,且大大節省時間,并且擴增產物還可測序,以終確定污染支原體的物種,增加可追溯性。因此還是值得大力推廣。

現在,市面上有些商品化試劑盒可以挑選,但需要注意它們應達到歐洲藥典或日本藥典標準,例如靈敏度、耐用性和特異性方面,需要經過全面驗證。下面以德國MB公司的試劑盒(Venor®GeM qEP)為例,對這類試劑盒略做介紹。

該試劑盒擴增柔膜體對應的16S rRNA上的特異序列, 而真核細胞和其他細菌DNA不會被擴增。
 
試劑盒可同時對細胞培養上清篩查以及那些需要遵循歐洲藥典和日本藥典放行檢測。整個檢測小于3小時。和一些生化和細胞學方法相比,PCR具有更高的靈敏度和準確性。
 
試劑盒包含所有必要的PCR組分,包括引物和探針。其中內控DNA可用于鑒定PCR抑制或DNA抽提問題帶來的假陰性。內控DNA可直接加到PCR預混液里,或加到DNA抽提之前的樣本中。它可用于驗證DNA抽提和qPCR擴增過程。內控對照的擴增結果在560nm檢測(HEX通道),而支原體的擴增在520nm檢測(FAM通道)。
 
試劑盒包括dUTP,它替代dTTP,方便用尿嘧啶DNA糖基酶(UNG)監視假陽性。該試劑盒不包含UNG。

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